Protein–RNA interactions for Protein: P28566

HTR1E, 5-hydroxytryptamine receptor 1E, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR1EP28566 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HTR1EP28566 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HTR1EP28566 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HTR1EP28566 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HTR1EP28566 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HTR1EP28566 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HTR1EP28566 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HTR1EP28566 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HTR1EP28566 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HTR1EP28566 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HTR1EP28566 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HTR1EP28566 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HTR1EP28566 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HTR1EP28566 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HTR1EP28566 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HTR1EP28566 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HTR1EP28566 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HTR1EP28566 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HTR1EP28566 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HTR1EP28566 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
HTR1EP28566 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HTR1EP28566 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HTR1EP28566 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HTR1EP28566 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
HTR1EP28566 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HTR1EP28566 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HTR1EP28566 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HTR1EP28566 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HTR1EP28566 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HTR1EP28566 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HTR1EP28566 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HTR1EP28566 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HTR1EP28566 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HTR1EP28566 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HTR1EP28566 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
HTR1EP28566 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
HTR1EP28566 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HTR1EP28566 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HTR1EP28566 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HTR1EP28566 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HTR1EP28566 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HTR1EP28566 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HTR1EP28566 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HTR1EP28566 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HTR1EP28566 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HTR1EP28566 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HTR1EP28566 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
HTR1EP28566 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HTR1EP28566 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HTR1EP28566 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HTR1EP28566 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HTR1EP28566 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HTR1EP28566 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HTR1EP28566 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HTR1EP28566 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HTR1EP28566 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HTR1EP28566 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HTR1EP28566 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HTR1EP28566 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HTR1EP28566 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HTR1EP28566 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HTR1EP28566 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HTR1EP28566 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HTR1EP28566 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HTR1EP28566 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HTR1EP28566 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HTR1EP28566 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HTR1EP28566 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HTR1EP28566 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HTR1EP28566 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HTR1EP28566 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HTR1EP28566 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HTR1EP28566 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HTR1EP28566 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HTR1EP28566 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HTR1EP28566 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HTR1EP28566 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HTR1EP28566 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HTR1EP28566 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HTR1EP28566 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HTR1EP28566 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HTR1EP28566 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HTR1EP28566 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HTR1EP28566 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HTR1EP28566 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HTR1EP28566 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HTR1EP28566 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HTR1EP28566 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HTR1EP28566 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HTR1EP28566 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HTR1EP28566 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HTR1EP28566 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HTR1EP28566 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HTR1EP28566 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HTR1EP28566 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HTR1EP28566 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HTR1EP28566 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HTR1EP28566 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HTR1EP28566 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HTR1EP28566 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms