Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
DUSP1P28562 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms