Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLD1P28340 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
POLD1P28340 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLD1P28340 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLD1P28340 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLD1P28340 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLD1P28340 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLD1P28340 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLD1P28340 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLD1P28340 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLD1P28340 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLD1P28340 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLD1P28340 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLD1P28340 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLD1P28340 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLD1P28340 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLD1P28340 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
POLD1P28340 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLD1P28340 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLD1P28340 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLD1P28340 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLD1P28340 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLD1P28340 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLD1P28340 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLD1P28340 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLD1P28340 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLD1P28340 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLD1P28340 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLD1P28340 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLD1P28340 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLD1P28340 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLD1P28340 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLD1P28340 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLD1P28340 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLD1P28340 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLD1P28340 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLD1P28340 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLD1P28340 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLD1P28340 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLD1P28340 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLD1P28340 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLD1P28340 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLD1P28340 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
POLD1P28340 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLD1P28340 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLD1P28340 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLD1P28340 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLD1P28340 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLD1P28340 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLD1P28340 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLD1P28340 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLD1P28340 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
POLD1P28340 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
POLD1P28340 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLD1P28340 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLD1P28340 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLD1P28340 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLD1P28340 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLD1P28340 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLD1P28340 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLD1P28340 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLD1P28340 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLD1P28340 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLD1P28340 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLD1P28340 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLD1P28340 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLD1P28340 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLD1P28340 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLD1P28340 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLD1P28340 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLD1P28340 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLD1P28340 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLD1P28340 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLD1P28340 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLD1P28340 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLD1P28340 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLD1P28340 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLD1P28340 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLD1P28340 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLD1P28340 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLD1P28340 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLD1P28340 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLD1P28340 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLD1P28340 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLD1P28340 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLD1P28340 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLD1P28340 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
POLD1P28340 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
POLD1P28340 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
POLD1P28340 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
POLD1P28340 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
POLD1P28340 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLD1P28340 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLD1P28340 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLD1P28340 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLD1P28340 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLD1P28340 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLD1P28340 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLD1P28340 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
POLD1P28340 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms