Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEX2P28328 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEX2P28328 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEX2P28328 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEX2P28328 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PEX2P28328 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PEX2P28328 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PEX2P28328 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PEX2P28328 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PEX2P28328 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PEX2P28328 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PEX2P28328 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PEX2P28328 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PEX2P28328 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PEX2P28328 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PEX2P28328 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PEX2P28328 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PEX2P28328 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PEX2P28328 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PEX2P28328 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PEX2P28328 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PEX2P28328 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PEX2P28328 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PEX2P28328 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PEX2P28328 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PEX2P28328 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PEX2P28328 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PEX2P28328 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PEX2P28328 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PEX2P28328 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PEX2P28328 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PEX2P28328 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PEX2P28328 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PEX2P28328 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PEX2P28328 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PEX2P28328 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PEX2P28328 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PEX2P28328 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PEX2P28328 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PEX2P28328 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PEX2P28328 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PEX2P28328 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PEX2P28328 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PEX2P28328 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PEX2P28328 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PEX2P28328 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PEX2P28328 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PEX2P28328 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PEX2P28328 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PEX2P28328 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PEX2P28328 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PEX2P28328 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PEX2P28328 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PEX2P28328 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PEX2P28328 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PEX2P28328 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PEX2P28328 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PEX2P28328 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PEX2P28328 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PEX2P28328 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PEX2P28328 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PEX2P28328 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PEX2P28328 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PEX2P28328 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PEX2P28328 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PEX2P28328 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PEX2P28328 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PEX2P28328 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PEX2P28328 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PEX2P28328 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PEX2P28328 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PEX2P28328 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PEX2P28328 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PEX2P28328 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PEX2P28328 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PEX2P28328 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PEX2P28328 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PEX2P28328 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PEX2P28328 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PEX2P28328 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PEX2P28328 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PEX2P28328 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PEX2P28328 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PEX2P28328 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PEX2P28328 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PEX2P28328 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PEX2P28328 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PEX2P28328 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PEX2P28328 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PEX2P28328 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PEX2P28328 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PEX2P28328 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PEX2P28328 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PEX2P28328 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PEX2P28328 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PEX2P28328 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PEX2P28328 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PEX2P28328 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PEX2P28328 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PEX2P28328 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.3 ms