Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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PSMB9P28065 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms