Protein–RNA interactions for Protein: P27695

APEX1, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX1P27695 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APEX1P27695 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APEX1P27695 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APEX1P27695 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APEX1P27695 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APEX1P27695 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APEX1P27695 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APEX1P27695 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APEX1P27695 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APEX1P27695 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APEX1P27695 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APEX1P27695 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APEX1P27695 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APEX1P27695 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APEX1P27695 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APEX1P27695 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
APEX1P27695 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APEX1P27695 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APEX1P27695 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APEX1P27695 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APEX1P27695 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APEX1P27695 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APEX1P27695 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APEX1P27695 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APEX1P27695 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APEX1P27695 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APEX1P27695 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APEX1P27695 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APEX1P27695 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APEX1P27695 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APEX1P27695 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APEX1P27695 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APEX1P27695 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APEX1P27695 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APEX1P27695 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
APEX1P27695 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APEX1P27695 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APEX1P27695 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APEX1P27695 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APEX1P27695 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APEX1P27695 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APEX1P27695 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APEX1P27695 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APEX1P27695 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APEX1P27695 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APEX1P27695 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APEX1P27695 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APEX1P27695 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APEX1P27695 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APEX1P27695 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APEX1P27695 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APEX1P27695 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APEX1P27695 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APEX1P27695 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APEX1P27695 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APEX1P27695 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APEX1P27695 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APEX1P27695 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APEX1P27695 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APEX1P27695 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APEX1P27695 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APEX1P27695 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APEX1P27695 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APEX1P27695 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APEX1P27695 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APEX1P27695 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APEX1P27695 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APEX1P27695 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APEX1P27695 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APEX1P27695 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APEX1P27695 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APEX1P27695 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APEX1P27695 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APEX1P27695 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APEX1P27695 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APEX1P27695 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APEX1P27695 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APEX1P27695 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APEX1P27695 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APEX1P27695 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APEX1P27695 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APEX1P27695 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APEX1P27695 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APEX1P27695 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APEX1P27695 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APEX1P27695 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APEX1P27695 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
APEX1P27695 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APEX1P27695 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APEX1P27695 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APEX1P27695 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APEX1P27695 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APEX1P27695 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APEX1P27695 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APEX1P27695 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APEX1P27695 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APEX1P27695 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APEX1P27695 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
APEX1P27695 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
APEX1P27695 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms