Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMA3P25788 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMA3P25788 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMA3P25788 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMA3P25788 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMA3P25788 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMA3P25788 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMA3P25788 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMA3P25788 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMA3P25788 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMA3P25788 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMA3P25788 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMA3P25788 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMA3P25788 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMA3P25788 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMA3P25788 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMA3P25788 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMA3P25788 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMA3P25788 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMA3P25788 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMA3P25788 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMA3P25788 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMA3P25788 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMA3P25788 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMA3P25788 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMA3P25788 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMA3P25788 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMA3P25788 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMA3P25788 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMA3P25788 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMA3P25788 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMA3P25788 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMA3P25788 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMA3P25788 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMA3P25788 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMA3P25788 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMA3P25788 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMA3P25788 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMA3P25788 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMA3P25788 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMA3P25788 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMA3P25788 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMA3P25788 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMA3P25788 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMA3P25788 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMA3P25788 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMA3P25788 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMA3P25788 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMA3P25788 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMA3P25788 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
PSMA3P25788 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMA3P25788 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMA3P25788 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMA3P25788 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMA3P25788 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMA3P25788 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMA3P25788 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMA3P25788 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMA3P25788 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMA3P25788 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMA3P25788 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMA3P25788 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMA3P25788 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMA3P25788 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMA3P25788 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMA3P25788 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMA3P25788 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMA3P25788 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMA3P25788 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMA3P25788 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMA3P25788 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMA3P25788 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMA3P25788 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMA3P25788 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMA3P25788 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMA3P25788 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMA3P25788 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMA3P25788 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMA3P25788 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMA3P25788 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMA3P25788 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMA3P25788 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMA3P25788 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMA3P25788 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMA3P25788 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMA3P25788 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMA3P25788 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMA3P25788 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMA3P25788 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMA3P25788 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMA3P25788 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMA3P25788 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMA3P25788 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMA3P25788 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMA3P25788 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMA3P25788 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMA3P25788 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMA3P25788 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMA3P25788 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMA3P25788 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms