Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR2AP24928 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR2AP24928 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR2AP24928 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR2AP24928 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR2AP24928 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR2AP24928 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR2AP24928 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR2AP24928 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR2AP24928 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR2AP24928 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR2AP24928 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR2AP24928 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR2AP24928 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR2AP24928 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR2AP24928 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR2AP24928 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
POLR2AP24928 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLR2AP24928 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLR2AP24928 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLR2AP24928 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLR2AP24928 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLR2AP24928 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLR2AP24928 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLR2AP24928 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLR2AP24928 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLR2AP24928 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLR2AP24928 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLR2AP24928 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLR2AP24928 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLR2AP24928 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLR2AP24928 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLR2AP24928 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLR2AP24928 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLR2AP24928 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
POLR2AP24928 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
POLR2AP24928 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLR2AP24928 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLR2AP24928 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLR2AP24928 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
POLR2AP24928 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR2AP24928 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR2AP24928 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR2AP24928 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR2AP24928 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR2AP24928 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR2AP24928 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR2AP24928 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR2AP24928 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR2AP24928 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR2AP24928 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR2AP24928 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR2AP24928 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR2AP24928 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR2AP24928 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR2AP24928 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR2AP24928 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR2AP24928 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR2AP24928 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR2AP24928 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR2AP24928 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR2AP24928 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR2AP24928 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR2AP24928 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR2AP24928 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR2AP24928 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR2AP24928 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR2AP24928 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR2AP24928 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR2AP24928 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR2AP24928 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR2AP24928 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR2AP24928 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR2AP24928 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
POLR2AP24928 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
POLR2AP24928 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
POLR2AP24928 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
POLR2AP24928 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
POLR2AP24928 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
POLR2AP24928 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
POLR2AP24928 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
POLR2AP24928 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
POLR2AP24928 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.84
POLR2AP24928 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
POLR2AP24928 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
POLR2AP24928 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
POLR2AP24928 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
POLR2AP24928 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
POLR2AP24928 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
POLR2AP24928 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
POLR2AP24928 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
POLR2AP24928 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLR2AP24928 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLR2AP24928 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLR2AP24928 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLR2AP24928 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLR2AP24928 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLR2AP24928 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLR2AP24928 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLR2AP24928 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms