Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPRGP23470 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPRGP23470 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPRGP23470 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPRGP23470 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPRGP23470 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPRGP23470 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPRGP23470 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPRGP23470 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPRGP23470 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPRGP23470 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPRGP23470 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPRGP23470 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPRGP23470 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPRGP23470 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPRGP23470 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPRGP23470 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPRGP23470 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPRGP23470 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPRGP23470 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPRGP23470 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPRGP23470 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PTPRGP23470 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
PTPRGP23470 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
PTPRGP23470 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PTPRGP23470 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
PTPRGP23470 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PTPRGP23470 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PTPRGP23470 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PTPRGP23470 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PTPRGP23470 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PTPRGP23470 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PTPRGP23470 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PTPRGP23470 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PTPRGP23470 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PTPRGP23470 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPRGP23470 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPRGP23470 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPRGP23470 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPRGP23470 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPRGP23470 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPRGP23470 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPRGP23470 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPRGP23470 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPRGP23470 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPRGP23470 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPRGP23470 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPRGP23470 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPRGP23470 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPRGP23470 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPRGP23470 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPRGP23470 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPRGP23470 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPRGP23470 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPRGP23470 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPRGP23470 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPRGP23470 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPRGP23470 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPRGP23470 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPRGP23470 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPRGP23470 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPRGP23470 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPRGP23470 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPRGP23470 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPRGP23470 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPRGP23470 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPRGP23470 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPRGP23470 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPRGP23470 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPRGP23470 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPRGP23470 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPRGP23470 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPRGP23470 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPRGP23470 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPRGP23470 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPRGP23470 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPRGP23470 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPRGP23470 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPRGP23470 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPRGP23470 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPRGP23470 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPRGP23470 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRGP23470 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRGP23470 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRGP23470 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRGP23470 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRGP23470 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRGP23470 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRGP23470 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRGP23470 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRGP23470 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRGP23470 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRGP23470 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRGP23470 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRGP23470 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRGP23470 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRGP23470 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRGP23470 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRGP23470 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRGP23470 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
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