Protein–RNA interactions for Protein: P23434

GCSH, Glycine cleavage system H protein, mitochondrial, humanhuman

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Length 173 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP23434 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
GCSHP23434 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
GCSHP23434 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
GCSHP23434 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
GCSHP23434 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
GCSHP23434 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
GCSHP23434 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
GCSHP23434 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
GCSHP23434 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
GCSHP23434 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
GCSHP23434 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
GCSHP23434 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
GCSHP23434 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
GCSHP23434 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
GCSHP23434 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
GCSHP23434 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
GCSHP23434 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
GCSHP23434 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
GCSHP23434 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
GCSHP23434 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
GCSHP23434 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
GCSHP23434 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
GCSHP23434 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC12.84□□□□□ -0.35
GCSHP23434 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
GCSHP23434 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
GCSHP23434 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
GCSHP23434 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
GCSHP23434 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
GCSHP23434 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
GCSHP23434 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
GCSHP23434 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
GCSHP23434 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
GCSHP23434 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
GCSHP23434 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC12.84□□□□□ -0.35
GCSHP23434 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
GCSHP23434 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
GCSHP23434 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
GCSHP23434 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
GCSHP23434 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
GCSHP23434 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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GCSHP23434 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
GCSHP23434 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
GCSHP23434 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
GCSHP23434 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
GCSHP23434 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
GCSHP23434 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
GCSHP23434 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
GCSHP23434 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
GCSHP23434 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
GCSHP23434 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
GCSHP23434 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
GCSHP23434 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
GCSHP23434 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
GCSHP23434 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
GCSHP23434 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
GCSHP23434 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
GCSHP23434 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
GCSHP23434 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
GCSHP23434 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
GCSHP23434 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
GCSHP23434 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
GCSHP23434 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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GCSHP23434 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
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GCSHP23434 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
GCSHP23434 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
GCSHP23434 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
GCSHP23434 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
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GCSHP23434 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
GCSHP23434 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
GCSHP23434 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
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GCSHP23434 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
GCSHP23434 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
GCSHP23434 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
GCSHP23434 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC12.83□□□□□ -0.36
GCSHP23434 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
GCSHP23434 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
GCSHP23434 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
GCSHP23434 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
GCSHP23434 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
GCSHP23434 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
GCSHP23434 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
GCSHP23434 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
GCSHP23434 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
GCSHP23434 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
GCSHP23434 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
GCSHP23434 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
GCSHP23434 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
GCSHP23434 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
GCSHP23434 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
GCSHP23434 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
GCSHP23434 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
GCSHP23434 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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