Protein–RNA interactions for Protein: P21709

EPHA1, Ephrin type-A receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA1P21709 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EPHA1P21709 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.07■□□□□ 0
EPHA1P21709 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EPHA1P21709 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EPHA1P21709 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EPHA1P21709 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EPHA1P21709 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EPHA1P21709 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EPHA1P21709 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EPHA1P21709 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EPHA1P21709 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.06■□□□□ 0
EPHA1P21709 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EPHA1P21709 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EPHA1P21709 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EPHA1P21709 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EPHA1P21709 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EPHA1P21709 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EPHA1P21709 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EPHA1P21709 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EPHA1P21709 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
EPHA1P21709 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EPHA1P21709 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EPHA1P21709 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
EPHA1P21709 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.06■□□□□ 0
EPHA1P21709 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EPHA1P21709 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.06■□□□□ 0
EPHA1P21709 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
EPHA1P21709 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.06■□□□□ 0
EPHA1P21709 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EPHA1P21709 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EPHA1P21709 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EPHA1P21709 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EPHA1P21709 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.06■□□□□ 0
EPHA1P21709 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EPHA1P21709 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EPHA1P21709 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EPHA1P21709 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EPHA1P21709 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EPHA1P21709 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EPHA1P21709 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EPHA1P21709 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EPHA1P21709 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.06■□□□□ 0
EPHA1P21709 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EPHA1P21709 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EPHA1P21709 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EPHA1P21709 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EPHA1P21709 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EPHA1P21709 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EPHA1P21709 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EPHA1P21709 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
EPHA1P21709 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EPHA1P21709 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
EPHA1P21709 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EPHA1P21709 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EPHA1P21709 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EPHA1P21709 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
EPHA1P21709 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EPHA1P21709 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
EPHA1P21709 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EPHA1P21709 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EPHA1P21709 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
EPHA1P21709 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EPHA1P21709 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EPHA1P21709 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EPHA1P21709 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EPHA1P21709 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.05■□□□□ -0
EPHA1P21709 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
EPHA1P21709 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
EPHA1P21709 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.05■□□□□ -0
EPHA1P21709 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
EPHA1P21709 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.05■□□□□ -0
EPHA1P21709 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
EPHA1P21709 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
EPHA1P21709 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EPHA1P21709 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EPHA1P21709 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
EPHA1P21709 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EPHA1P21709 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EPHA1P21709 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EPHA1P21709 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
EPHA1P21709 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
EPHA1P21709 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
EPHA1P21709 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
EPHA1P21709 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
EPHA1P21709 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EPHA1P21709 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EPHA1P21709 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EPHA1P21709 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EPHA1P21709 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EPHA1P21709 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EPHA1P21709 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EPHA1P21709 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EPHA1P21709 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EPHA1P21709 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EPHA1P21709 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.04■□□□□ -0
EPHA1P21709 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EPHA1P21709 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EPHA1P21709 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EPHA1P21709 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EPHA1P21709 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms