Protein–RNA interactions for Protein: P20719

HOXA5, Homeobox protein Hox-A5, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA5P20719 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXA5P20719 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms