Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms