Protein–RNA interactions for Protein: P20618

PSMB1, Proteasome subunit beta type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB1P20618 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PSMB1P20618 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms