Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNNI3P19429 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms