Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATF3P18847 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATF3P18847 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATF3P18847 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ATF3P18847 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATF3P18847 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATF3P18847 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATF3P18847 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ATF3P18847 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATF3P18847 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATF3P18847 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATF3P18847 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATF3P18847 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATF3P18847 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATF3P18847 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATF3P18847 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATF3P18847 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATF3P18847 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATF3P18847 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ATF3P18847 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATF3P18847 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATF3P18847 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATF3P18847 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ATF3P18847 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATF3P18847 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATF3P18847 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATF3P18847 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATF3P18847 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATF3P18847 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATF3P18847 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATF3P18847 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATF3P18847 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATF3P18847 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATF3P18847 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATF3P18847 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATF3P18847 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATF3P18847 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATF3P18847 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATF3P18847 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATF3P18847 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATF3P18847 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATF3P18847 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATF3P18847 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATF3P18847 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATF3P18847 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATF3P18847 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ATF3P18847 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ATF3P18847 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATF3P18847 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATF3P18847 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATF3P18847 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATF3P18847 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATF3P18847 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATF3P18847 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATF3P18847 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATF3P18847 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATF3P18847 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATF3P18847 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATF3P18847 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATF3P18847 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATF3P18847 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATF3P18847 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATF3P18847 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATF3P18847 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATF3P18847 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATF3P18847 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATF3P18847 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATF3P18847 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATF3P18847 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATF3P18847 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATF3P18847 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATF3P18847 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATF3P18847 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATF3P18847 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATF3P18847 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATF3P18847 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
ATF3P18847 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATF3P18847 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATF3P18847 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATF3P18847 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATF3P18847 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
ATF3P18847 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
ATF3P18847 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ATF3P18847 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATF3P18847 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATF3P18847 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATF3P18847 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATF3P18847 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATF3P18847 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATF3P18847 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATF3P18847 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATF3P18847 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ATF3P18847 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATF3P18847 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATF3P18847 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATF3P18847 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATF3P18847 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATF3P18847 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ATF3P18847 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATF3P18847 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms