Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRAP18433 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRAP18433 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRAP18433 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRAP18433 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRAP18433 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRAP18433 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRAP18433 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRAP18433 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRAP18433 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRAP18433 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRAP18433 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRAP18433 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRAP18433 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRAP18433 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRAP18433 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRAP18433 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRAP18433 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRAP18433 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
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PTPRAP18433 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRAP18433 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRAP18433 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRAP18433 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRAP18433 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRAP18433 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRAP18433 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRAP18433 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRAP18433 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRAP18433 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRAP18433 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRAP18433 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRAP18433 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRAP18433 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRAP18433 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRAP18433 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRAP18433 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
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PTPRAP18433 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
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PTPRAP18433 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRAP18433 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
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PTPRAP18433 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
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PTPRAP18433 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRAP18433 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
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PTPRAP18433 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRAP18433 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
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PTPRAP18433 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRAP18433 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
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PTPRAP18433 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
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PTPRAP18433 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRAP18433 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRAP18433 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRAP18433 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRAP18433 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRAP18433 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRAP18433 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRAP18433 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRAP18433 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRAP18433 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRAP18433 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
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