Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.3 ms