Protein–RNA interactions for Protein: P12110

COL6A2, Collagen alpha-2(VI) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,019 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL6A2P12110 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
COL6A2P12110 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
COL6A2P12110 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
COL6A2P12110 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
COL6A2P12110 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
COL6A2P12110 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
COL6A2P12110 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms