Protein–RNA interactions for Protein: P11686

SFTPC, Pulmonary surfactant-associated protein C, humanhuman

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Length 197 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPCP11686 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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