Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIGD3P0DMS9 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms