Protein–RNA interactions for Protein: P08962

CD63, CD63 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD63P08962 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD63P08962 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD63P08962 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD63P08962 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD63P08962 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD63P08962 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD63P08962 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD63P08962 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD63P08962 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD63P08962 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD63P08962 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD63P08962 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD63P08962 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD63P08962 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD63P08962 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD63P08962 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD63P08962 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD63P08962 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD63P08962 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD63P08962 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD63P08962 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD63P08962 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD63P08962 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD63P08962 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD63P08962 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD63P08962 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD63P08962 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CD63P08962 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CD63P08962 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD63P08962 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CD63P08962 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD63P08962 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD63P08962 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CD63P08962 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD63P08962 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD63P08962 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD63P08962 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD63P08962 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD63P08962 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD63P08962 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD63P08962 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD63P08962 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD63P08962 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD63P08962 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD63P08962 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD63P08962 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD63P08962 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD63P08962 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD63P08962 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD63P08962 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD63P08962 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD63P08962 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD63P08962 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD63P08962 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD63P08962 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD63P08962 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CD63P08962 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD63P08962 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD63P08962 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD63P08962 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD63P08962 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD63P08962 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD63P08962 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD63P08962 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD63P08962 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD63P08962 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD63P08962 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD63P08962 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CD63P08962 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CD63P08962 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD63P08962 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD63P08962 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD63P08962 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD63P08962 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CD63P08962 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CD63P08962 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD63P08962 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD63P08962 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD63P08962 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD63P08962 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD63P08962 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD63P08962 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD63P08962 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD63P08962 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD63P08962 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD63P08962 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD63P08962 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD63P08962 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD63P08962 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD63P08962 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD63P08962 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD63P08962 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD63P08962 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD63P08962 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD63P08962 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD63P08962 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD63P08962 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD63P08962 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD63P08962 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD63P08962 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms