Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHOP08100 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHOP08100 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHOP08100 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHOP08100 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHOP08100 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHOP08100 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHOP08100 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHOP08100 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHOP08100 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHOP08100 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHOP08100 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHOP08100 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHOP08100 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHOP08100 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RHOP08100 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHOP08100 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHOP08100 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHOP08100 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHOP08100 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHOP08100 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHOP08100 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHOP08100 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHOP08100 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHOP08100 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHOP08100 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHOP08100 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHOP08100 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHOP08100 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHOP08100 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHOP08100 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHOP08100 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RHOP08100 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHOP08100 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHOP08100 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHOP08100 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHOP08100 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RHOP08100 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RHOP08100 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHOP08100 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHOP08100 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHOP08100 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHOP08100 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHOP08100 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHOP08100 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHOP08100 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHOP08100 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHOP08100 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHOP08100 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHOP08100 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHOP08100 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHOP08100 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHOP08100 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHOP08100 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHOP08100 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHOP08100 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHOP08100 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHOP08100 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHOP08100 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHOP08100 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHOP08100 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHOP08100 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHOP08100 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHOP08100 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHOP08100 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHOP08100 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHOP08100 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHOP08100 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHOP08100 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHOP08100 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHOP08100 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHOP08100 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHOP08100 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHOP08100 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHOP08100 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHOP08100 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHOP08100 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHOP08100 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHOP08100 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHOP08100 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHOP08100 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHOP08100 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHOP08100 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHOP08100 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHOP08100 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHOP08100 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHOP08100 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHOP08100 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHOP08100 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHOP08100 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHOP08100 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHOP08100 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHOP08100 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHOP08100 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHOP08100 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHOP08100 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHOP08100 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHOP08100 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHOP08100 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHOP08100 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms