Protein–RNA interactions for Protein: P02776

PF4, Platelet factor 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PF4P02776 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PF4P02776 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PF4P02776 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PF4P02776 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PF4P02776 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PF4P02776 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PF4P02776 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PF4P02776 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PF4P02776 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PF4P02776 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PF4P02776 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PF4P02776 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PF4P02776 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PF4P02776 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PF4P02776 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PF4P02776 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PF4P02776 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PF4P02776 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PF4P02776 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PF4P02776 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PF4P02776 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PF4P02776 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PF4P02776 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PF4P02776 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PF4P02776 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PF4P02776 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PF4P02776 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PF4P02776 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PF4P02776 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PF4P02776 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PF4P02776 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PF4P02776 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PF4P02776 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PF4P02776 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PF4P02776 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PF4P02776 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PF4P02776 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PF4P02776 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PF4P02776 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PF4P02776 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PF4P02776 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PF4P02776 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PF4P02776 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PF4P02776 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PF4P02776 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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PF4P02776 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PF4P02776 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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PF4P02776 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PF4P02776 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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PF4P02776 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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PF4P02776 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PF4P02776 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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PF4P02776 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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PF4P02776 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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PF4P02776 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PF4P02776 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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PF4P02776 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PF4P02776 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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PF4P02776 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PF4P02776 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PF4P02776 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PF4P02776 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PF4P02776 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PF4P02776 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PF4P02776 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PF4P02776 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PF4P02776 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PF4P02776 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PF4P02776 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PF4P02776 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PF4P02776 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PF4P02776 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PF4P02776 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PF4P02776 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PF4P02776 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PF4P02776 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PF4P02776 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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