Protein–RNA interactions for Protein: P02461

COL3A1, Collagen alpha-1(III) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL3A1P02461 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL3A1P02461 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL3A1P02461 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL3A1P02461 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL3A1P02461 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL3A1P02461 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL3A1P02461 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL3A1P02461 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
COL3A1P02461 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL3A1P02461 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL3A1P02461 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL3A1P02461 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL3A1P02461 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL3A1P02461 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL3A1P02461 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL3A1P02461 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
COL3A1P02461 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL3A1P02461 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
COL3A1P02461 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL3A1P02461 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL3A1P02461 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
COL3A1P02461 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL3A1P02461 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL3A1P02461 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL3A1P02461 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL3A1P02461 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL3A1P02461 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
COL3A1P02461 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL3A1P02461 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL3A1P02461 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
COL3A1P02461 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
COL3A1P02461 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL3A1P02461 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL3A1P02461 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL3A1P02461 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL3A1P02461 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL3A1P02461 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL3A1P02461 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL3A1P02461 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL3A1P02461 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL3A1P02461 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL3A1P02461 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL3A1P02461 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL3A1P02461 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL3A1P02461 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL3A1P02461 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL3A1P02461 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
COL3A1P02461 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL3A1P02461 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL3A1P02461 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL3A1P02461 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL3A1P02461 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL3A1P02461 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL3A1P02461 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL3A1P02461 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL3A1P02461 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL3A1P02461 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL3A1P02461 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL3A1P02461 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL3A1P02461 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL3A1P02461 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL3A1P02461 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL3A1P02461 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
COL3A1P02461 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL3A1P02461 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL3A1P02461 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL3A1P02461 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL3A1P02461 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL3A1P02461 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL3A1P02461 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL3A1P02461 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL3A1P02461 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL3A1P02461 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL3A1P02461 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL3A1P02461 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL3A1P02461 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL3A1P02461 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL3A1P02461 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL3A1P02461 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL3A1P02461 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
COL3A1P02461 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL3A1P02461 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL3A1P02461 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL3A1P02461 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL3A1P02461 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL3A1P02461 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL3A1P02461 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL3A1P02461 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL3A1P02461 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL3A1P02461 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL3A1P02461 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL3A1P02461 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL3A1P02461 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL3A1P02461 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL3A1P02461 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL3A1P02461 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL3A1P02461 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL3A1P02461 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL3A1P02461 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL3A1P02461 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms