Protein–RNA interactions for Protein: O95819

MAP4K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP4K4O95819 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MAP4K4O95819 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MAP4K4O95819 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MAP4K4O95819 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MAP4K4O95819 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MAP4K4O95819 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MAP4K4O95819 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
MAP4K4O95819 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MAP4K4O95819 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MAP4K4O95819 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MAP4K4O95819 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MAP4K4O95819 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MAP4K4O95819 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MAP4K4O95819 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MAP4K4O95819 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MAP4K4O95819 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
MAP4K4O95819 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MAP4K4O95819 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MAP4K4O95819 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
MAP4K4O95819 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
MAP4K4O95819 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MAP4K4O95819 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MAP4K4O95819 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MAP4K4O95819 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MAP4K4O95819 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MAP4K4O95819 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MAP4K4O95819 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MAP4K4O95819 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
MAP4K4O95819 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MAP4K4O95819 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MAP4K4O95819 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MAP4K4O95819 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MAP4K4O95819 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MAP4K4O95819 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
MAP4K4O95819 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MAP4K4O95819 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MAP4K4O95819 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MAP4K4O95819 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MAP4K4O95819 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MAP4K4O95819 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MAP4K4O95819 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MAP4K4O95819 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
MAP4K4O95819 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MAP4K4O95819 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MAP4K4O95819 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MAP4K4O95819 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
MAP4K4O95819 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MAP4K4O95819 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MAP4K4O95819 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MAP4K4O95819 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MAP4K4O95819 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MAP4K4O95819 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MAP4K4O95819 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MAP4K4O95819 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MAP4K4O95819 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MAP4K4O95819 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MAP4K4O95819 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MAP4K4O95819 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MAP4K4O95819 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MAP4K4O95819 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MAP4K4O95819 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
MAP4K4O95819 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MAP4K4O95819 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MAP4K4O95819 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MAP4K4O95819 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MAP4K4O95819 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MAP4K4O95819 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MAP4K4O95819 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MAP4K4O95819 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MAP4K4O95819 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MAP4K4O95819 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MAP4K4O95819 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MAP4K4O95819 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MAP4K4O95819 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MAP4K4O95819 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
MAP4K4O95819 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MAP4K4O95819 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MAP4K4O95819 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MAP4K4O95819 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MAP4K4O95819 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MAP4K4O95819 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MAP4K4O95819 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MAP4K4O95819 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MAP4K4O95819 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MAP4K4O95819 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MAP4K4O95819 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MAP4K4O95819 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MAP4K4O95819 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MAP4K4O95819 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MAP4K4O95819 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MAP4K4O95819 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MAP4K4O95819 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MAP4K4O95819 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
MAP4K4O95819 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MAP4K4O95819 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MAP4K4O95819 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MAP4K4O95819 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MAP4K4O95819 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MAP4K4O95819 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MAP4K4O95819 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms