Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms