Protein–RNA interactions for Protein: O60636

TSPAN2, Tetraspanin-2, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN2O60636 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSPAN2O60636 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSPAN2O60636 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TSPAN2O60636 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSPAN2O60636 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSPAN2O60636 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TSPAN2O60636 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSPAN2O60636 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSPAN2O60636 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms