Protein–RNA interactions for Protein: O43246

SLC7A4, Cationic amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC7A4O43246 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC7A4O43246 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC7A4O43246 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC7A4O43246 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC7A4O43246 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC7A4O43246 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC7A4O43246 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC7A4O43246 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC7A4O43246 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC7A4O43246 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC7A4O43246 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC7A4O43246 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC7A4O43246 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC7A4O43246 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC7A4O43246 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC7A4O43246 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC7A4O43246 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC7A4O43246 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC7A4O43246 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC7A4O43246 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC7A4O43246 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC7A4O43246 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC7A4O43246 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC7A4O43246 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC7A4O43246 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC7A4O43246 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC7A4O43246 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC7A4O43246 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC7A4O43246 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC7A4O43246 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC7A4O43246 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC7A4O43246 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC7A4O43246 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC7A4O43246 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC7A4O43246 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC7A4O43246 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC7A4O43246 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC7A4O43246 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC7A4O43246 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC7A4O43246 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC7A4O43246 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC7A4O43246 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC7A4O43246 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC7A4O43246 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC7A4O43246 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC7A4O43246 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC7A4O43246 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC7A4O43246 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC7A4O43246 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC7A4O43246 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC7A4O43246 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC7A4O43246 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC7A4O43246 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC7A4O43246 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC7A4O43246 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC7A4O43246 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC7A4O43246 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC7A4O43246 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC7A4O43246 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC7A4O43246 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC7A4O43246 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC7A4O43246 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC7A4O43246 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC7A4O43246 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC7A4O43246 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC7A4O43246 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC7A4O43246 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC7A4O43246 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC7A4O43246 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC7A4O43246 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC7A4O43246 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC7A4O43246 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC7A4O43246 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC7A4O43246 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC7A4O43246 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC7A4O43246 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC7A4O43246 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC7A4O43246 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC7A4O43246 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC7A4O43246 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC7A4O43246 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC7A4O43246 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC7A4O43246 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC7A4O43246 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC7A4O43246 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC7A4O43246 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC7A4O43246 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC7A4O43246 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC7A4O43246 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC7A4O43246 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC7A4O43246 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC7A4O43246 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC7A4O43246 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC7A4O43246 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC7A4O43246 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC7A4O43246 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC7A4O43246 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC7A4O43246 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC7A4O43246 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC7A4O43246 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.8 ms