Protein–RNA interactions for Protein: O43189

PHF1, PHD finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF1O43189 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHF1O43189 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHF1O43189 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHF1O43189 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHF1O43189 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHF1O43189 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHF1O43189 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHF1O43189 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHF1O43189 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHF1O43189 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHF1O43189 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHF1O43189 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHF1O43189 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHF1O43189 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHF1O43189 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHF1O43189 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHF1O43189 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHF1O43189 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHF1O43189 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHF1O43189 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHF1O43189 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHF1O43189 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHF1O43189 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHF1O43189 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHF1O43189 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHF1O43189 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PHF1O43189 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHF1O43189 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PHF1O43189 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHF1O43189 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHF1O43189 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PHF1O43189 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHF1O43189 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHF1O43189 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHF1O43189 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHF1O43189 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHF1O43189 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PHF1O43189 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHF1O43189 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHF1O43189 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PHF1O43189 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHF1O43189 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHF1O43189 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHF1O43189 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHF1O43189 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHF1O43189 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHF1O43189 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHF1O43189 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHF1O43189 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHF1O43189 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHF1O43189 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHF1O43189 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHF1O43189 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHF1O43189 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHF1O43189 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHF1O43189 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHF1O43189 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHF1O43189 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHF1O43189 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHF1O43189 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHF1O43189 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHF1O43189 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHF1O43189 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHF1O43189 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHF1O43189 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHF1O43189 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHF1O43189 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHF1O43189 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHF1O43189 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PHF1O43189 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHF1O43189 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PHF1O43189 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHF1O43189 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHF1O43189 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHF1O43189 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHF1O43189 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PHF1O43189 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHF1O43189 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHF1O43189 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHF1O43189 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHF1O43189 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHF1O43189 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHF1O43189 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHF1O43189 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHF1O43189 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHF1O43189 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHF1O43189 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHF1O43189 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PHF1O43189 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHF1O43189 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHF1O43189 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHF1O43189 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHF1O43189 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHF1O43189 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHF1O43189 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHF1O43189 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHF1O43189 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHF1O43189 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHF1O43189 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHF1O43189 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms