Protein–RNA interactions for Protein: O15540

FABP7, Fatty acid-binding protein, brain, humanhuman

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FABP7O15540 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
FABP7O15540 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FABP7O15540 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FABP7O15540 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FABP7O15540 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FABP7O15540 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FABP7O15540 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FABP7O15540 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FABP7O15540 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FABP7O15540 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FABP7O15540 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FABP7O15540 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FABP7O15540 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FABP7O15540 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FABP7O15540 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FABP7O15540 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FABP7O15540 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FABP7O15540 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FABP7O15540 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FABP7O15540 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FABP7O15540 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FABP7O15540 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FABP7O15540 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FABP7O15540 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FABP7O15540 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FABP7O15540 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
FABP7O15540 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FABP7O15540 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FABP7O15540 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
FABP7O15540 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FABP7O15540 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
FABP7O15540 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FABP7O15540 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FABP7O15540 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FABP7O15540 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FABP7O15540 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FABP7O15540 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
FABP7O15540 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
FABP7O15540 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FABP7O15540 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FABP7O15540 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FABP7O15540 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FABP7O15540 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FABP7O15540 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FABP7O15540 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FABP7O15540 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FABP7O15540 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
FABP7O15540 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
FABP7O15540 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
FABP7O15540 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FABP7O15540 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FABP7O15540 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
FABP7O15540 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
FABP7O15540 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FABP7O15540 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FABP7O15540 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FABP7O15540 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FABP7O15540 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FABP7O15540 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FABP7O15540 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FABP7O15540 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FABP7O15540 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FABP7O15540 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FABP7O15540 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FABP7O15540 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FABP7O15540 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FABP7O15540 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FABP7O15540 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FABP7O15540 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FABP7O15540 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FABP7O15540 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FABP7O15540 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FABP7O15540 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FABP7O15540 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FABP7O15540 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FABP7O15540 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FABP7O15540 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FABP7O15540 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FABP7O15540 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FABP7O15540 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FABP7O15540 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FABP7O15540 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FABP7O15540 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FABP7O15540 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FABP7O15540 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FABP7O15540 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FABP7O15540 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FABP7O15540 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FABP7O15540 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FABP7O15540 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FABP7O15540 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FABP7O15540 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FABP7O15540 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FABP7O15540 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FABP7O15540 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FABP7O15540 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FABP7O15540 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FABP7O15540 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FABP7O15540 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FABP7O15540 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms