Protein–RNA interactions for Protein: I3L3R5

CCER2, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER2I3L3R5 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCER2I3L3R5 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCER2I3L3R5 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCER2I3L3R5 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCER2I3L3R5 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCER2I3L3R5 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCER2I3L3R5 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CCER2I3L3R5 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCER2I3L3R5 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCER2I3L3R5 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCER2I3L3R5 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCER2I3L3R5 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCER2I3L3R5 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CCER2I3L3R5 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CCER2I3L3R5 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCER2I3L3R5 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCER2I3L3R5 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCER2I3L3R5 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CCER2I3L3R5 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CCER2I3L3R5 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CCER2I3L3R5 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCER2I3L3R5 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCER2I3L3R5 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCER2I3L3R5 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCER2I3L3R5 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCER2I3L3R5 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCER2I3L3R5 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCER2I3L3R5 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCER2I3L3R5 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCER2I3L3R5 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCER2I3L3R5 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCER2I3L3R5 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCER2I3L3R5 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCER2I3L3R5 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCER2I3L3R5 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCER2I3L3R5 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCER2I3L3R5 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCER2I3L3R5 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCER2I3L3R5 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCER2I3L3R5 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCER2I3L3R5 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCER2I3L3R5 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CCER2I3L3R5 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCER2I3L3R5 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCER2I3L3R5 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCER2I3L3R5 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCER2I3L3R5 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCER2I3L3R5 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCER2I3L3R5 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCER2I3L3R5 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCER2I3L3R5 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCER2I3L3R5 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCER2I3L3R5 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CCER2I3L3R5 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCER2I3L3R5 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CCER2I3L3R5 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCER2I3L3R5 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCER2I3L3R5 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCER2I3L3R5 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CCER2I3L3R5 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCER2I3L3R5 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCER2I3L3R5 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCER2I3L3R5 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCER2I3L3R5 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCER2I3L3R5 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCER2I3L3R5 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCER2I3L3R5 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCER2I3L3R5 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCER2I3L3R5 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CCER2I3L3R5 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCER2I3L3R5 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCER2I3L3R5 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCER2I3L3R5 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCER2I3L3R5 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCER2I3L3R5 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCER2I3L3R5 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCER2I3L3R5 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCER2I3L3R5 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCER2I3L3R5 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCER2I3L3R5 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCER2I3L3R5 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCER2I3L3R5 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCER2I3L3R5 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCER2I3L3R5 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCER2I3L3R5 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCER2I3L3R5 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CCER2I3L3R5 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCER2I3L3R5 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCER2I3L3R5 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCER2I3L3R5 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCER2I3L3R5 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCER2I3L3R5 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCER2I3L3R5 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCER2I3L3R5 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCER2I3L3R5 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCER2I3L3R5 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCER2I3L3R5 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CCER2I3L3R5 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCER2I3L3R5 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCER2I3L3R5 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms