Protein–RNA interactions for Protein: E9PKD4

NPIPA5, Nuclear pore complex-interacting protein family member A5, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPA5E9PKD4 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPIPA5E9PKD4 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPIPA5E9PKD4 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPIPA5E9PKD4 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPIPA5E9PKD4 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPIPA5E9PKD4 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPIPA5E9PKD4 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPIPA5E9PKD4 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPIPA5E9PKD4 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPIPA5E9PKD4 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPIPA5E9PKD4 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NPIPA5E9PKD4 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPIPA5E9PKD4 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NPIPA5E9PKD4 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPIPA5E9PKD4 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NPIPA5E9PKD4 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPIPA5E9PKD4 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NPIPA5E9PKD4 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NPIPA5E9PKD4 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPIPA5E9PKD4 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPIPA5E9PKD4 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPIPA5E9PKD4 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPIPA5E9PKD4 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPIPA5E9PKD4 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPIPA5E9PKD4 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPIPA5E9PKD4 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPIPA5E9PKD4 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPIPA5E9PKD4 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPIPA5E9PKD4 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPIPA5E9PKD4 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPIPA5E9PKD4 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPIPA5E9PKD4 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPIPA5E9PKD4 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPIPA5E9PKD4 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPIPA5E9PKD4 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPIPA5E9PKD4 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPIPA5E9PKD4 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPIPA5E9PKD4 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPIPA5E9PKD4 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPIPA5E9PKD4 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPIPA5E9PKD4 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPIPA5E9PKD4 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPIPA5E9PKD4 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPIPA5E9PKD4 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPIPA5E9PKD4 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NPIPA5E9PKD4 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPIPA5E9PKD4 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPIPA5E9PKD4 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPIPA5E9PKD4 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPIPA5E9PKD4 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPIPA5E9PKD4 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPIPA5E9PKD4 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NPIPA5E9PKD4 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPIPA5E9PKD4 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPIPA5E9PKD4 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPIPA5E9PKD4 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPIPA5E9PKD4 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPIPA5E9PKD4 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPIPA5E9PKD4 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPIPA5E9PKD4 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPIPA5E9PKD4 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPIPA5E9PKD4 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NPIPA5E9PKD4 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPIPA5E9PKD4 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPIPA5E9PKD4 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPIPA5E9PKD4 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPIPA5E9PKD4 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPIPA5E9PKD4 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPIPA5E9PKD4 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPIPA5E9PKD4 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPIPA5E9PKD4 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NPIPA5E9PKD4 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NPIPA5E9PKD4 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NPIPA5E9PKD4 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NPIPA5E9PKD4 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NPIPA5E9PKD4 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NPIPA5E9PKD4 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NPIPA5E9PKD4 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NPIPA5E9PKD4 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NPIPA5E9PKD4 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NPIPA5E9PKD4 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NPIPA5E9PKD4 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NPIPA5E9PKD4 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NPIPA5E9PKD4 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NPIPA5E9PKD4 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NPIPA5E9PKD4 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NPIPA5E9PKD4 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NPIPA5E9PKD4 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NPIPA5E9PKD4 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NPIPA5E9PKD4 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NPIPA5E9PKD4 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NPIPA5E9PKD4 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NPIPA5E9PKD4 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NPIPA5E9PKD4 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NPIPA5E9PKD4 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NPIPA5E9PKD4 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NPIPA5E9PKD4 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NPIPA5E9PKD4 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NPIPA5E9PKD4 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NPIPA5E9PKD4 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.1 ms