Protein–RNA interactions for Protein: C9J3I9

C5orf58, Putative uncharacterized protein C5orf58, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf58C9J3I9 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C5orf58C9J3I9 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C5orf58C9J3I9 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C5orf58C9J3I9 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C5orf58C9J3I9 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C5orf58C9J3I9 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C5orf58C9J3I9 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C5orf58C9J3I9 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C5orf58C9J3I9 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C5orf58C9J3I9 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C5orf58C9J3I9 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
C5orf58C9J3I9 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C5orf58C9J3I9 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
C5orf58C9J3I9 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
C5orf58C9J3I9 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C5orf58C9J3I9 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C5orf58C9J3I9 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C5orf58C9J3I9 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C5orf58C9J3I9 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms