Protein–RNA interactions for Protein: B7ZW38

HNRNPCL3, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein C-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNRNPCL3B7ZW38 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HNRNPCL3B7ZW38 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HNRNPCL3B7ZW38 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HNRNPCL3B7ZW38 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HNRNPCL3B7ZW38 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HNRNPCL3B7ZW38 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HNRNPCL3B7ZW38 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HNRNPCL3B7ZW38 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
HNRNPCL3B7ZW38 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HNRNPCL3B7ZW38 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HNRNPCL3B7ZW38 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HNRNPCL3B7ZW38 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HNRNPCL3B7ZW38 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HNRNPCL3B7ZW38 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HNRNPCL3B7ZW38 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HNRNPCL3B7ZW38 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HNRNPCL3B7ZW38 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HNRNPCL3B7ZW38 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HNRNPCL3B7ZW38 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HNRNPCL3B7ZW38 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HNRNPCL3B7ZW38 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HNRNPCL3B7ZW38 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HNRNPCL3B7ZW38 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HNRNPCL3B7ZW38 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HNRNPCL3B7ZW38 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
HNRNPCL3B7ZW38 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HNRNPCL3B7ZW38 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HNRNPCL3B7ZW38 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HNRNPCL3B7ZW38 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
HNRNPCL3B7ZW38 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HNRNPCL3B7ZW38 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
HNRNPCL3B7ZW38 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HNRNPCL3B7ZW38 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HNRNPCL3B7ZW38 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HNRNPCL3B7ZW38 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HNRNPCL3B7ZW38 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HNRNPCL3B7ZW38 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HNRNPCL3B7ZW38 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HNRNPCL3B7ZW38 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HNRNPCL3B7ZW38 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HNRNPCL3B7ZW38 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
HNRNPCL3B7ZW38 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HNRNPCL3B7ZW38 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HNRNPCL3B7ZW38 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HNRNPCL3B7ZW38 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HNRNPCL3B7ZW38 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HNRNPCL3B7ZW38 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HNRNPCL3B7ZW38 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HNRNPCL3B7ZW38 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HNRNPCL3B7ZW38 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HNRNPCL3B7ZW38 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HNRNPCL3B7ZW38 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
HNRNPCL3B7ZW38 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HNRNPCL3B7ZW38 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HNRNPCL3B7ZW38 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HNRNPCL3B7ZW38 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HNRNPCL3B7ZW38 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HNRNPCL3B7ZW38 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HNRNPCL3B7ZW38 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HNRNPCL3B7ZW38 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HNRNPCL3B7ZW38 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HNRNPCL3B7ZW38 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HNRNPCL3B7ZW38 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HNRNPCL3B7ZW38 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HNRNPCL3B7ZW38 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HNRNPCL3B7ZW38 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HNRNPCL3B7ZW38 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HNRNPCL3B7ZW38 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HNRNPCL3B7ZW38 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HNRNPCL3B7ZW38 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HNRNPCL3B7ZW38 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HNRNPCL3B7ZW38 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HNRNPCL3B7ZW38 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HNRNPCL3B7ZW38 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HNRNPCL3B7ZW38 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HNRNPCL3B7ZW38 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HNRNPCL3B7ZW38 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HNRNPCL3B7ZW38 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HNRNPCL3B7ZW38 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HNRNPCL3B7ZW38 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HNRNPCL3B7ZW38 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HNRNPCL3B7ZW38 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HNRNPCL3B7ZW38 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HNRNPCL3B7ZW38 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HNRNPCL3B7ZW38 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HNRNPCL3B7ZW38 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HNRNPCL3B7ZW38 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HNRNPCL3B7ZW38 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HNRNPCL3B7ZW38 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HNRNPCL3B7ZW38 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
HNRNPCL3B7ZW38 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HNRNPCL3B7ZW38 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HNRNPCL3B7ZW38 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HNRNPCL3B7ZW38 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HNRNPCL3B7ZW38 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HNRNPCL3B7ZW38 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HNRNPCL3B7ZW38 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HNRNPCL3B7ZW38 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HNRNPCL3B7ZW38 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HNRNPCL3B7ZW38 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms