Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms