Protein–RNA interactions for Protein: A8K0R7

ZNF839, Zinc finger protein 839, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF839A8K0R7 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNF839A8K0R7 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms