Protein–RNA interactions for Protein: A6NLU5

VSTM2B, V-set and transmembrane domain-containing protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM2BA6NLU5 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VSTM2BA6NLU5 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VSTM2BA6NLU5 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VSTM2BA6NLU5 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VSTM2BA6NLU5 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VSTM2BA6NLU5 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VSTM2BA6NLU5 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VSTM2BA6NLU5 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VSTM2BA6NLU5 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VSTM2BA6NLU5 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VSTM2BA6NLU5 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VSTM2BA6NLU5 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VSTM2BA6NLU5 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VSTM2BA6NLU5 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VSTM2BA6NLU5 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VSTM2BA6NLU5 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
VSTM2BA6NLU5 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VSTM2BA6NLU5 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VSTM2BA6NLU5 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VSTM2BA6NLU5 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VSTM2BA6NLU5 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VSTM2BA6NLU5 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VSTM2BA6NLU5 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VSTM2BA6NLU5 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VSTM2BA6NLU5 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VSTM2BA6NLU5 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VSTM2BA6NLU5 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VSTM2BA6NLU5 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VSTM2BA6NLU5 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VSTM2BA6NLU5 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VSTM2BA6NLU5 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
VSTM2BA6NLU5 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VSTM2BA6NLU5 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VSTM2BA6NLU5 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VSTM2BA6NLU5 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
VSTM2BA6NLU5 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VSTM2BA6NLU5 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VSTM2BA6NLU5 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VSTM2BA6NLU5 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VSTM2BA6NLU5 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VSTM2BA6NLU5 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VSTM2BA6NLU5 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VSTM2BA6NLU5 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VSTM2BA6NLU5 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VSTM2BA6NLU5 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VSTM2BA6NLU5 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VSTM2BA6NLU5 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VSTM2BA6NLU5 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VSTM2BA6NLU5 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VSTM2BA6NLU5 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VSTM2BA6NLU5 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VSTM2BA6NLU5 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
VSTM2BA6NLU5 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VSTM2BA6NLU5 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VSTM2BA6NLU5 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VSTM2BA6NLU5 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VSTM2BA6NLU5 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VSTM2BA6NLU5 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VSTM2BA6NLU5 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VSTM2BA6NLU5 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VSTM2BA6NLU5 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VSTM2BA6NLU5 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
VSTM2BA6NLU5 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VSTM2BA6NLU5 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VSTM2BA6NLU5 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VSTM2BA6NLU5 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VSTM2BA6NLU5 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VSTM2BA6NLU5 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VSTM2BA6NLU5 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VSTM2BA6NLU5 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VSTM2BA6NLU5 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VSTM2BA6NLU5 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
VSTM2BA6NLU5 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VSTM2BA6NLU5 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VSTM2BA6NLU5 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VSTM2BA6NLU5 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VSTM2BA6NLU5 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VSTM2BA6NLU5 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VSTM2BA6NLU5 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VSTM2BA6NLU5 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VSTM2BA6NLU5 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VSTM2BA6NLU5 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VSTM2BA6NLU5 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VSTM2BA6NLU5 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VSTM2BA6NLU5 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VSTM2BA6NLU5 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VSTM2BA6NLU5 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VSTM2BA6NLU5 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VSTM2BA6NLU5 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VSTM2BA6NLU5 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VSTM2BA6NLU5 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VSTM2BA6NLU5 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VSTM2BA6NLU5 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VSTM2BA6NLU5 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VSTM2BA6NLU5 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VSTM2BA6NLU5 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VSTM2BA6NLU5 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VSTM2BA6NLU5 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VSTM2BA6NLU5 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VSTM2BA6NLU5 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.1 ms