Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RGPD3A6NKT7 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RGPD3A6NKT7 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RGPD3A6NKT7 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RGPD3A6NKT7 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RGPD3A6NKT7 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RGPD3A6NKT7 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RGPD3A6NKT7 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
RGPD3A6NKT7 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RGPD3A6NKT7 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RGPD3A6NKT7 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RGPD3A6NKT7 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RGPD3A6NKT7 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RGPD3A6NKT7 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RGPD3A6NKT7 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RGPD3A6NKT7 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RGPD3A6NKT7 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RGPD3A6NKT7 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RGPD3A6NKT7 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RGPD3A6NKT7 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RGPD3A6NKT7 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RGPD3A6NKT7 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RGPD3A6NKT7 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RGPD3A6NKT7 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RGPD3A6NKT7 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RGPD3A6NKT7 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RGPD3A6NKT7 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RGPD3A6NKT7 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RGPD3A6NKT7 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RGPD3A6NKT7 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RGPD3A6NKT7 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RGPD3A6NKT7 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RGPD3A6NKT7 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RGPD3A6NKT7 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RGPD3A6NKT7 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RGPD3A6NKT7 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RGPD3A6NKT7 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RGPD3A6NKT7 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RGPD3A6NKT7 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RGPD3A6NKT7 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RGPD3A6NKT7 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RGPD3A6NKT7 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RGPD3A6NKT7 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RGPD3A6NKT7 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RGPD3A6NKT7 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RGPD3A6NKT7 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RGPD3A6NKT7 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RGPD3A6NKT7 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RGPD3A6NKT7 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RGPD3A6NKT7 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RGPD3A6NKT7 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RGPD3A6NKT7 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RGPD3A6NKT7 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RGPD3A6NKT7 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RGPD3A6NKT7 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms