Protein–RNA interactions for Protein: A2A3N6

PIPSL, Putative PIP5K1A and PSMD4-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIPSLA2A3N6 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms