Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ARL2-SNX15V9GYD0 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ARL2-SNX15V9GYD0 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
ARL2-SNX15V9GYD0 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
ARL2-SNX15V9GYD0 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ARL2-SNX15V9GYD0 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ARL2-SNX15V9GYD0 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ARL2-SNX15V9GYD0 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ARL2-SNX15V9GYD0 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ARL2-SNX15V9GYD0 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ARL2-SNX15V9GYD0 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ARL2-SNX15V9GYD0 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ARL2-SNX15V9GYD0 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ARL2-SNX15V9GYD0 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms