Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q1

CAPN6, Calpain-6, humanhuman

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN6Q9Y6Q1 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPN6Q9Y6Q1 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPN6Q9Y6Q1 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPN6Q9Y6Q1 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPN6Q9Y6Q1 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPN6Q9Y6Q1 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPN6Q9Y6Q1 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPN6Q9Y6Q1 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPN6Q9Y6Q1 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPN6Q9Y6Q1 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPN6Q9Y6Q1 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPN6Q9Y6Q1 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPN6Q9Y6Q1 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPN6Q9Y6Q1 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPN6Q9Y6Q1 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPN6Q9Y6Q1 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPN6Q9Y6Q1 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPN6Q9Y6Q1 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPN6Q9Y6Q1 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPN6Q9Y6Q1 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPN6Q9Y6Q1 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPN6Q9Y6Q1 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPN6Q9Y6Q1 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPN6Q9Y6Q1 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPN6Q9Y6Q1 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPN6Q9Y6Q1 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPN6Q9Y6Q1 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPN6Q9Y6Q1 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPN6Q9Y6Q1 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPN6Q9Y6Q1 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPN6Q9Y6Q1 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPN6Q9Y6Q1 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CAPN6Q9Y6Q1 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CAPN6Q9Y6Q1 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CAPN6Q9Y6Q1 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CAPN6Q9Y6Q1 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CAPN6Q9Y6Q1 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CAPN6Q9Y6Q1 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CAPN6Q9Y6Q1 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
CAPN6Q9Y6Q1 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CAPN6Q9Y6Q1 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CAPN6Q9Y6Q1 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CAPN6Q9Y6Q1 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CAPN6Q9Y6Q1 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CAPN6Q9Y6Q1 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CAPN6Q9Y6Q1 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CAPN6Q9Y6Q1 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CAPN6Q9Y6Q1 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CAPN6Q9Y6Q1 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CAPN6Q9Y6Q1 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CAPN6Q9Y6Q1 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CAPN6Q9Y6Q1 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CAPN6Q9Y6Q1 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CAPN6Q9Y6Q1 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CAPN6Q9Y6Q1 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CAPN6Q9Y6Q1 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CAPN6Q9Y6Q1 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CAPN6Q9Y6Q1 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CAPN6Q9Y6Q1 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CAPN6Q9Y6Q1 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CAPN6Q9Y6Q1 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CAPN6Q9Y6Q1 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CAPN6Q9Y6Q1 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CAPN6Q9Y6Q1 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CAPN6Q9Y6Q1 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CAPN6Q9Y6Q1 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CAPN6Q9Y6Q1 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CAPN6Q9Y6Q1 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CAPN6Q9Y6Q1 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CAPN6Q9Y6Q1 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CAPN6Q9Y6Q1 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CAPN6Q9Y6Q1 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAPN6Q9Y6Q1 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAPN6Q9Y6Q1 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAPN6Q9Y6Q1 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAPN6Q9Y6Q1 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAPN6Q9Y6Q1 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAPN6Q9Y6Q1 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAPN6Q9Y6Q1 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAPN6Q9Y6Q1 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAPN6Q9Y6Q1 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAPN6Q9Y6Q1 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAPN6Q9Y6Q1 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAPN6Q9Y6Q1 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAPN6Q9Y6Q1 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CAPN6Q9Y6Q1 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CAPN6Q9Y6Q1 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAPN6Q9Y6Q1 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAPN6Q9Y6Q1 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAPN6Q9Y6Q1 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAPN6Q9Y6Q1 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAPN6Q9Y6Q1 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAPN6Q9Y6Q1 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAPN6Q9Y6Q1 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAPN6Q9Y6Q1 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAPN6Q9Y6Q1 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAPN6Q9Y6Q1 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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