Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms