Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y385

UBE2J1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 J1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2J1Q9Y385 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms