Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2M5

KLHL20, Kelch-like protein 20, humanhuman

Predictions only

Length 609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL20Q9Y2M5 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL20Q9Y2M5 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL20Q9Y2M5 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL20Q9Y2M5 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL20Q9Y2M5 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL20Q9Y2M5 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL20Q9Y2M5 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL20Q9Y2M5 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL20Q9Y2M5 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL20Q9Y2M5 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL20Q9Y2M5 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL20Q9Y2M5 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL20Q9Y2M5 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL20Q9Y2M5 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL20Q9Y2M5 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL20Q9Y2M5 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL20Q9Y2M5 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL20Q9Y2M5 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL20Q9Y2M5 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL20Q9Y2M5 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL20Q9Y2M5 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL20Q9Y2M5 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL20Q9Y2M5 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL20Q9Y2M5 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL20Q9Y2M5 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL20Q9Y2M5 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL20Q9Y2M5 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL20Q9Y2M5 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL20Q9Y2M5 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL20Q9Y2M5 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL20Q9Y2M5 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL20Q9Y2M5 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL20Q9Y2M5 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL20Q9Y2M5 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL20Q9Y2M5 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL20Q9Y2M5 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL20Q9Y2M5 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL20Q9Y2M5 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL20Q9Y2M5 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL20Q9Y2M5 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL20Q9Y2M5 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL20Q9Y2M5 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL20Q9Y2M5 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL20Q9Y2M5 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL20Q9Y2M5 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL20Q9Y2M5 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL20Q9Y2M5 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL20Q9Y2M5 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL20Q9Y2M5 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL20Q9Y2M5 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL20Q9Y2M5 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL20Q9Y2M5 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL20Q9Y2M5 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL20Q9Y2M5 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL20Q9Y2M5 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL20Q9Y2M5 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL20Q9Y2M5 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL20Q9Y2M5 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL20Q9Y2M5 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL20Q9Y2M5 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL20Q9Y2M5 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL20Q9Y2M5 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL20Q9Y2M5 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL20Q9Y2M5 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL20Q9Y2M5 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL20Q9Y2M5 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL20Q9Y2M5 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL20Q9Y2M5 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL20Q9Y2M5 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL20Q9Y2M5 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL20Q9Y2M5 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL20Q9Y2M5 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL20Q9Y2M5 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL20Q9Y2M5 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL20Q9Y2M5 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL20Q9Y2M5 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL20Q9Y2M5 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL20Q9Y2M5 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL20Q9Y2M5 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL20Q9Y2M5 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL20Q9Y2M5 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL20Q9Y2M5 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL20Q9Y2M5 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL20Q9Y2M5 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL20Q9Y2M5 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL20Q9Y2M5 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL20Q9Y2M5 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL20Q9Y2M5 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL20Q9Y2M5 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL20Q9Y2M5 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL20Q9Y2M5 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL20Q9Y2M5 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL20Q9Y2M5 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL20Q9Y2M5 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL20Q9Y2M5 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL20Q9Y2M5 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL20Q9Y2M5 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL20Q9Y2M5 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL20Q9Y2M5 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL20Q9Y2M5 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms