Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms