Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKE5

TNIK, TRAF2 and NCK-interacting protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIKQ9UKE5 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TNIKQ9UKE5 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TNIKQ9UKE5 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
TNIKQ9UKE5 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TNIKQ9UKE5 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TNIKQ9UKE5 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TNIKQ9UKE5 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TNIKQ9UKE5 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TNIKQ9UKE5 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TNIKQ9UKE5 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TNIKQ9UKE5 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TNIKQ9UKE5 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TNIKQ9UKE5 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TNIKQ9UKE5 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TNIKQ9UKE5 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TNIKQ9UKE5 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TNIKQ9UKE5 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TNIKQ9UKE5 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TNIKQ9UKE5 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TNIKQ9UKE5 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TNIKQ9UKE5 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TNIKQ9UKE5 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TNIKQ9UKE5 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TNIKQ9UKE5 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TNIKQ9UKE5 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TNIKQ9UKE5 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TNIKQ9UKE5 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TNIKQ9UKE5 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TNIKQ9UKE5 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
TNIKQ9UKE5 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TNIKQ9UKE5 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
TNIKQ9UKE5 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TNIKQ9UKE5 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TNIKQ9UKE5 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TNIKQ9UKE5 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TNIKQ9UKE5 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TNIKQ9UKE5 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TNIKQ9UKE5 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TNIKQ9UKE5 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TNIKQ9UKE5 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TNIKQ9UKE5 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TNIKQ9UKE5 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TNIKQ9UKE5 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TNIKQ9UKE5 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
TNIKQ9UKE5 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TNIKQ9UKE5 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TNIKQ9UKE5 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TNIKQ9UKE5 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TNIKQ9UKE5 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TNIKQ9UKE5 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TNIKQ9UKE5 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TNIKQ9UKE5 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TNIKQ9UKE5 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
TNIKQ9UKE5 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TNIKQ9UKE5 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TNIKQ9UKE5 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TNIKQ9UKE5 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TNIKQ9UKE5 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TNIKQ9UKE5 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TNIKQ9UKE5 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TNIKQ9UKE5 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TNIKQ9UKE5 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TNIKQ9UKE5 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TNIKQ9UKE5 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TNIKQ9UKE5 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TNIKQ9UKE5 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TNIKQ9UKE5 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TNIKQ9UKE5 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TNIKQ9UKE5 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TNIKQ9UKE5 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TNIKQ9UKE5 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TNIKQ9UKE5 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TNIKQ9UKE5 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TNIKQ9UKE5 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
TNIKQ9UKE5 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
TNIKQ9UKE5 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
TNIKQ9UKE5 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TNIKQ9UKE5 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TNIKQ9UKE5 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TNIKQ9UKE5 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TNIKQ9UKE5 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TNIKQ9UKE5 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TNIKQ9UKE5 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TNIKQ9UKE5 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TNIKQ9UKE5 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TNIKQ9UKE5 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TNIKQ9UKE5 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TNIKQ9UKE5 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TNIKQ9UKE5 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TNIKQ9UKE5 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TNIKQ9UKE5 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TNIKQ9UKE5 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TNIKQ9UKE5 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TNIKQ9UKE5 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TNIKQ9UKE5 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TNIKQ9UKE5 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TNIKQ9UKE5 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TNIKQ9UKE5 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TNIKQ9UKE5 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TNIKQ9UKE5 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms