Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGM1

CHRNA9, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA9Q9UGM1 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms