Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CGGBP1Q9UFW8 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms