Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NKX1-2Q9UD57 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NKX1-2Q9UD57 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NKX1-2Q9UD57 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NKX1-2Q9UD57 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NKX1-2Q9UD57 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NKX1-2Q9UD57 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NKX1-2Q9UD57 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NKX1-2Q9UD57 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NKX1-2Q9UD57 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NKX1-2Q9UD57 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NKX1-2Q9UD57 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NKX1-2Q9UD57 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NKX1-2Q9UD57 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NKX1-2Q9UD57 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NKX1-2Q9UD57 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NKX1-2Q9UD57 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NKX1-2Q9UD57 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NKX1-2Q9UD57 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NKX1-2Q9UD57 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NKX1-2Q9UD57 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NKX1-2Q9UD57 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NKX1-2Q9UD57 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NKX1-2Q9UD57 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NKX1-2Q9UD57 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NKX1-2Q9UD57 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NKX1-2Q9UD57 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NKX1-2Q9UD57 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NKX1-2Q9UD57 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NKX1-2Q9UD57 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NKX1-2Q9UD57 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NKX1-2Q9UD57 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NKX1-2Q9UD57 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NKX1-2Q9UD57 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NKX1-2Q9UD57 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NKX1-2Q9UD57 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NKX1-2Q9UD57 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NKX1-2Q9UD57 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NKX1-2Q9UD57 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NKX1-2Q9UD57 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NKX1-2Q9UD57 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NKX1-2Q9UD57 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NKX1-2Q9UD57 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NKX1-2Q9UD57 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NKX1-2Q9UD57 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NKX1-2Q9UD57 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NKX1-2Q9UD57 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NKX1-2Q9UD57 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NKX1-2Q9UD57 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NKX1-2Q9UD57 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NKX1-2Q9UD57 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NKX1-2Q9UD57 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NKX1-2Q9UD57 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NKX1-2Q9UD57 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NKX1-2Q9UD57 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NKX1-2Q9UD57 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NKX1-2Q9UD57 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NKX1-2Q9UD57 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NKX1-2Q9UD57 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NKX1-2Q9UD57 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NKX1-2Q9UD57 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NKX1-2Q9UD57 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NKX1-2Q9UD57 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NKX1-2Q9UD57 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NKX1-2Q9UD57 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NKX1-2Q9UD57 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NKX1-2Q9UD57 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NKX1-2Q9UD57 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NKX1-2Q9UD57 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NKX1-2Q9UD57 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NKX1-2Q9UD57 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NKX1-2Q9UD57 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NKX1-2Q9UD57 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NKX1-2Q9UD57 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NKX1-2Q9UD57 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NKX1-2Q9UD57 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NKX1-2Q9UD57 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NKX1-2Q9UD57 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NKX1-2Q9UD57 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NKX1-2Q9UD57 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NKX1-2Q9UD57 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NKX1-2Q9UD57 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NKX1-2Q9UD57 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NKX1-2Q9UD57 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NKX1-2Q9UD57 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NKX1-2Q9UD57 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NKX1-2Q9UD57 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NKX1-2Q9UD57 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NKX1-2Q9UD57 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NKX1-2Q9UD57 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NKX1-2Q9UD57 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NKX1-2Q9UD57 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NKX1-2Q9UD57 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NKX1-2Q9UD57 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NKX1-2Q9UD57 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NKX1-2Q9UD57 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NKX1-2Q9UD57 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NKX1-2Q9UD57 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NKX1-2Q9UD57 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NKX1-2Q9UD57 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms